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花椰菜苗期发生的主要病害有黑腐病、霜霉病等。防治常采取温汤浸种后拌药的方法处理种子,即将种子放入50℃温水中浸泡10分钟,捞出后用种子重量0.4%的50%福美双或75%百菌清拌种。苗期霜霉病发生严重的田块,可用58%甲霜灵•代森锰锌600倍液喷雾防治。
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